近日，福建省農科院果樹研究所團隊聯合中國農業科學院深圳農業基因組研究所團隊，在蓮霧基因組學研究領域獲得重要進展，建立了首個蓮霧高質量基因組。相關成果已發表于期刊《園藝研究》。
熱帶特色果樹蓮霧，原產于馬來群島，于400多年前引入中國。由于形態獨特，果皮色澤艷麗，全果可鮮食，口感清甜脆爽，富含多種對人體有益的抗氧化物，深受消費者喜愛。但目前，應用于商業生產的蓮霧品種較少，且這些品種大多無種子或僅有少量種子，采用傳統雜交育種手段選育新品種，效率低下。引入現代分子育種技術，有助于改變蓮霧育種難現狀。因此，有必要解析蓮霧基因組，構建基因組進化關系，挖掘優異基因，推進蓮霧育種工作。
研究團隊對多種測序技術獲得的數據進行聯合分析，獲得1.59Gb大小的同源四倍體蓮霧的單倍型基因組序列，并注釋獲得74888個高質量蛋白編碼基因和24016個等位基因。分析基因組進化信息發現，蓮霧和同為桃金娘科的巨桉，遺傳關系最接近。
在比較轉錄組分析的基礎上，研究團隊篩選出調控蓮霧果實大小、糖代謝以及雄性不育的關鍵基因。
其中，“AP2”基因可能通過調節萼片發育調控果實大??；糖轉運相關基因“SWEET”和“SUT”，可能與含糖量有關；調控絨氈層早期發育的關鍵基因“DYT1”和“TDF1”，可能在蓮霧的育性調控中發揮潛在的作用。
福建省農科院果樹研究所副研究員魏秀清、中國農業科學院深圳農業基因組研究所博士陳敏為論文共同第一作者，福建省農科院果樹研究所研究員許家輝為通訊作者。
